Les activités du laboratoire de bactériologie moléculaire portent sur un problème majeur de Santé Publique à savoir la résistance aux antibiotiques. Les travaux de recherche réalisés dans le laboratoire de bactériologie moléculaire sont axés essentiellement sur l’identification des mécanismes de résistance aux bétalactamines et aux quinolones chez les bactéries à gram négatif notamment les entérobactéries et chez les grams positifs, les staphylocoques et les entérocoques. De même et devant l’augmentation de la résistance aux antibiotiques et la diminution de la mise sur le marché de nouvelles molécules d’antibiotiques, notre laboratoire s’intéresse également à l’effet de certaines substances Chimiques et enzymatiques sur les souches de certaines bactéries pathogènes sous forme libre et/ou en vie communautaire sous forme de biofilms. Par ailleurs, le laboratoire participe à la formation et à l’encadrement des étudiants des différentes universités du royaume dans le cadre de la préparation de différents diplômes universitaires (Master, Doctorat, Projet de fin d’étude, diplôme d’Ingénieur). Le laboratoire est également impliqué dans les enseignements universitaires, en particulier dans la formation des Master en Microbiologie .

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Responsable

 Timinouni Mohammed		Chercheur

Membres de l'équipe

• El Azhari Mohamed		Chercheur

• Bourjilat Fatna			Chercheur

• Nayme Kaotar			Assistante de Recherche

• Barguigua Aboudihaj		Post-Doc

• Oufrid Salwa			Doctorante

• Hannioui Imane			Doctorante

• Ghazlane Zineb			Doctorante

• Serraj Bahija			Doctorante

Travaux en cours:

La résistance des entérobactéries aux céphalosporines de troisième génération (ERC3G), notamment par production d’enzymes (ß-Lactamases à Spectre Etendu ou BLSE, céphalosporinase de type AmpC et Carbapenèmases), a augmenté ces dernières années de façon très préoccupante. Ces enzymes sont portées par des éléments génétiques mobiles et transmissibles, et donc très épidémiques. La résistance par mécanisme enzymatique s’est installée dans la communauté, touchant ainsi les bactéries les plus couramment rencontrées. Ceci incite les cliniciens à recourir aux cabapénèmes, qui sont souvent le dernier rempart thérapeutique dans les infections graves.

Concernant la résistance aux quinolones longuement considérée comme étant d’origine chromosomique quatre nouveaux mécanismes de résistance a médiation plasmidique ont été récemment décrits à savoir, les gènes qnrA, B, S, C et D, le gène aac(6’)-Ib-cr, le gène qepA, et le gène oqxAB.

Sur le plan phénotypique, la résistance dite à bas niveau conférée par ces mécanismes reste difficilement décelable, mais son association éventuelle aux mécanismes chromosomiques induit une augmentation considérable des CMI de la ciprofloxacine.

Toutefois, peu de données sont disponibles au Maroc sur la prévalence de ces gènes de résistance plasmidique chez les entérobactéries. C’est ainsi que notre étude, se veut à la fois prospective, analytique et comparative, s’intéressant surtout aux entérobactéries isolées en milieu communautaire marocain, dans une optique visant à étudier leur contenu génétique plasmidique quant à ces mécanismes de résistance aux quinolones. Nos projets de recherche s’intéressent également à l’étude de la coexistence de ces gènes PMQR avec les gènes de résistance aux ß-lactamines

En termes de santé publique, nos travaux sur la résistance permettront d’établir une cartographie de l’état de la résistance aux antibiotiques chez les entérobactéries d’origine communautaire et renforcer la maitrise et le contrôl de ces résistances au Maroc par l’élaboration d’un réseau de surveillance.

Dans leur environnement naturel, les microorganismes se développent majoritairement et préférentiellement à l’état sessile fixés sur des supports, organisés en communautés structurées, et englobés dans une matrice d’exopolysaccharide désigné le slime. Ce mode de vie microbienne est appelé biofilms. Ces derniers peuvent être à l’origine de problèmes sérieux dont l’impact économique et sanitaire est considérable.

Dans cette optique notre étude a pour but principale l’utilisation des produits chimiques, synthétiques et enzymatiques pour désorganiser la matrice qui protège le biofilm. Ces applications pourraient sans doute constituer un moyen abordable en assurant une hygiène optimale des surfaces dans divers secteurs et en l’occurrence éliminer les bactéries pathogènes résistantes.

En plus de leur capacité de résistance à de nombreux antibiotiques, les entérocoques sont souvent porteurs de facteurs de virulence qui favorisent la colonisation et l'invasion tissulaire de l'hôte et leurs assurent une protection vis-à-vis des réponses immunitaires innées et acquises. Bien que plusieurs protéines de surface et sécrétées impliquées dans la virulence aient été identifiées, peu de choses sont connues concernant les mécanismes de la pathogenèse chez E. faecalis. En plus ces bactéries du tube digestif pourraient constituer un réservoir de gènes de résistance de type VanB. Notre laboratoire s’intéresse à la détermination de la prévalence des entérocoques vancoR du portage intestinal ainsi que l’identification du mécanisme moléculaire impliqué dans les résistances à la vancomycine et aux aminoglycosides.

Staphylococcus aureus est l’un des microorganismes pathogènes offrant le plus de résistance. Il se développe sur les muqueuses et la peau d’environ un tiers de la population, et il s’adapte très rapidement à la pression sélective des antibiotiques. Ce fut la première bactérie à présenter une résistance à la pénicilline, dès 1947, soit cinq ans après le début de la production de masse de cet antibiotique. La methicilline était alors l’antibiotique de choix. Le SARM (Staphylococcus aureus résistants à la methicilline) a été découvert en 1961 en grand Bretagne. Le SARM est désormais assez courant en milieu hospitalier, puis en milieu communautaire.

Parmi les antibiotiques utilisés en thérapie humaine, l’acide fusidique qui est un antibiotique lentement bactéricide et un peu plus actif sur les souches de S. aureus sensibles à la methicilline que sur celle résistantes.

Nos recherches sont focalisées sur la détermination de la prévalence des SARM hospitalier et extrahospitalier, leur typage agr, ainsi que leur habillage toxinique.

L’analyse des mécanismes de résistance à l’acide fusidique et le typage des souches multirésistantes est aussi explorée.

Ce sont des bactéries intracellulaires responsables de manifestations pathologiques extrêmement sévères et variées aussi bien chez l’Homme que chez de nombreuses espèces animales, selon l’espèce infectante et le site infecté

Chlamydia trachomatis et les mycoplasmes urogénitaux représentent les premières infections sexuellement transmissibles de part le monde, dans la majorité des cas asymptomatiques et inapparentes. L’infection à C. trachomatis peut se compliquer chez la femme en grossesse extra-utérine ou en infertilité, suite à l’inflammation et l’obstruction des trompes. Chez l'homme, elle peut être responsable d'urétrites qui se compliquent en prostatites et épididymites. Cependant, l’infection par les Mycoplasmes urogénitaux peut être à l’origine des avortements. Les Chlamydiae et les mycoplasmes sont impliquées dans des pathologies spécialement génitales, mais certaines souches sont responsables de pathologies oculaires, respiratoires et peuvent être impliqués dans les maladies cardiovasculaires.

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Résponsable

Membres de l'équipe

• Loubna ELYAZOULI               Etudiante

• Zakaria EL YAZGHI              Etudiant

• Siham ETTOURABI                Etudiante

Soumaya MAOUHOUB               Etudiante

Missions

1-Assurer l'activité de diagnostic de ces infections

2-Entreprendre des activités de recherche en rapport avec les Chlamydiae, les Mycoplasmes et les pathologies qui leurs sont associées dans l’objectif de :

-Etablir des programmes de surveillance

-Adopter une stratégie de prise en charge et de contrôle de ces infections afin de limiter leur évolution et complications redoutables

Travaux en cours :

projet 1

Objectif : Evaluation du degré d’association par une étude Cas/témoins et la caractérisation moléculaire des souches circulantes.

: Chlamydophila pneumoniae (C. pneumoniae) est une bactérie intracellulaire obligatoire. Il est surtout connu comme un agent pathogène respiratoire, responsable des pneumonies communautaires, des bronchites et des sinusites. De nombreuses études ont montré que C. pneumoniae peut être impliqué dans le développement des maladies cardiovasculaires, particulièrement l'athérosclérose qui est un véritable problème de santé publique dans le monde entier. À travers notre travail nous prévoyons évaluer la part de l'infection à C. pneumoniae chez des patients atteints de maladies cardiovasculaires, en menant une étude Immunologiques et moléculaires (étude cas/témoins).

projet 2

Objectif :Le but principal de cette étude est d'évaluer le taux d'infection par les mycoplasmes urogénitaux, étudier la sensibilité aux antibiotiques des souches circulantes et effectuer une étude moléculaire des gènes de résistance.

Dans un travail effectué dans notre laboratoire, nous avons pu déceler une forte prévalence d’Ureaplsma urealyticum et Mycoplasma hominis avec un taux alarmant d’antibio-résistance. A la lumière de ces résultats , nous avons décider de mener en une surveillance des infections à Mycoplasmes urogénitaux chez des patients présentant des pathologies urogénitales, chez qui nous recherchons toutes les espèces de Mycoplasmes impliquées dans les infections urogénitales, effectuer leur caractérisation moléculaires et étudier le gènes de résistance aux antibiotiques

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